MAN Purwokerto 2 merupakan penyelenggara pendidikan yang bernaung di bawah kementerian Agama (KEMENAG) Republik indonesia, sehubungan dengan ini karena pada tanggal 3 Januari adalah merupakan Hari Amal Bakti Kementerian Agama, maka yang termasuk jajaran kementerian agama seluruh indonesia memperingatinya, di sekolah MA N Purwokerto 2 memperingati dengan melaksanakan upacara bendera dalam rangka HAB KEMENAG, dalam sambutannya Drs. Pujiono selaku pembina upacara menyampaikan bahwa siswa MAN harus rajin, disiplin, dan berakhlakul karimah, karena sekolah ini sedang di prioritaskan menjadi sekolah berprestasi di kawasan karesidenan Banyumas di jajaran Kementerian Agama, jadi jika tidak didukung dengan siswa yang demikian rasanya akan mustahil cita – cita menjadi sekolah berprestasi akan terwujud, beliau juga menyampaikan himbauan kepada kelas XII yang dalam kurun waktu kurang lebih 3 – 4 bulan lagi menghadapi ujian, untuk senantiasa belajar belajar dan belajar. Bagi siswa kelas XI harus sudah mulai mengumpulkan nilai bagus untuk persiapan kelulusan di kelas XII, karena kelulusan di mulai dari kelas XI dalam penghitungan nilai Raport nya, dalam suasana yang tidak panas di pagi itu juga,,, menjadikan upacara berlangsung hikmat, dan tidak banyak siswa – siswa yang sakit tidak seperti pada saat panas, beliau juga menyampaikan, bahwa dengan semangan HAB KEMENAG di harapkan menjadikan siswa – siswi MAN Purwokerto 2 menjadi lebih baik dan bisa membawa nama baik Pribadi Keluarga dan MAN Purwokerto 2 setelah lulus dari sekolah.